La compatibilità di tutti gli strumenti disponibili all'interno del portale SSE è assicurata dall'implementazione di metodi standard per la comunicazione tra i vari servizi e per l'accesso ai dati satellitari supportati.
Ogni servizio all'interno del portale SSE prevede come input un archivio con una struttura standardizzata a seconda del tipo di dati contenuti nell'archivio, e restituisce come output un archivio con le immagini processate, anch`esso conforme al medesimo standard. Questa compatibilità tra gli archivi di input ed output consente di utilizzare i vari servizi in una catena di lavoro e quindi di poter usufruire in modo sequenziale di diverse elaborazioni.